提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
海外消费者也爱中国年:“春节”成购物搜索关键词 兔年摆件受热捧******
中新社北京1月17日电 (记者 夏宾)兔年春节临近,跨境电商平台上的海外消费者也在置办“春节年货”。
17日,跨境电商平台速卖通公布海外消费者最爱买的十大年货,红红火火的兔年摆件、“新年战袍”晚礼服、“神秘东方力量”保温杯、“保暖神器”滑雪内衣、仪式感拉满的智能氛围灯等国货强势增长,成为春节爆款。
中国春节在海外的影响力正逐渐增强。今年春节前夕,速卖通上有超200个国家和地区的用户,搜索了“Chinese New Year(中国新年)”“Rabbit Year(兔年)”“Spring Festival(春节)”等关键词的春节类相关商品。
其中,包含“rabbit”等兔年元素关键词的搜索量,2022年12月环比增长141%;而“春节”相关的关键词搜索量,在此前一年强势爆发的基础上仍呈两位数增长。
速卖通上的跨境商家也早早嗅到了海外消费者对中国传统佳节的热情,加大了春节年货商品的备货量。据速卖通行业运营人员顾沉介绍,今年平台春节节庆商品规模同比增长100%,平台也加大了站内外营销资源投入帮助春节国货出海。
数据显示,红包、灯笼、春联、窗花、中国结类挂饰、新春装饰等春节年货热销海外,12月销售额同比增长560%,还在持续增长中。
记者也在速卖通平台看到,一款抱着元宝、造型可爱的兔子生肖摆件部分款式已经售罄,近300条评论都给出了五星好评,表示“质量好”“物流快”。除了兔子摆件外,更多“含兔量”高的商品也在热销,包括手链、年画、灯饰、衣物等。(完)
(文图:赵筱尘 巫邓炎)